home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00320 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  43 lines
  1. ******************************************************************
  2. * Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase active site *
  3. ******************************************************************
  4.  
  5. The major mutagenic and  carcinogenic effect of methylating agents in  DNA  is
  6. the formation of O6-alkylguanine.  The repair  of  DNA containing O6-alkylated
  7. guanine is carried out by the  enzyme 6-O-methylguanine-DNA  methyltransferase
  8. (EC 2.1.1.63) (methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase) (MGMT). The
  9. alkyl  group at the O-6 position is  transferred to a  cysteine residue in the
  10. enzyme [1]. This is a suicide reaction: the enzyme is irreversibly inactivated
  11. and  the  methylated protein  accumulates as a dead-end product. Most, but not
  12. all MGMT are also  able to repair O-4-methylthymine.  MGMT sequences have been
  13. obtained from various prokaryotic [2] and eukaryotic sources:
  14.  
  15.  - Escherichia coli and  Salmonella typhimurium inducible bifunctional protein
  16.    ada.  The N-terminal part of the ada protein functions as a transcriptional
  17.    activator of its own gene and of other alkylation repair genes,  while  the
  18.    C-terminal part functions as a MGMT.
  19.  - Bacillus subtilis adaB. In this bacteria the function of the ada complex is
  20.    carried out by two proteins: adaA, a transcriptional activator, and adaB, a
  21.    MGMT.
  22.  - Escherichia coli constitutive (non-inducible) Ogt enzyme.
  23.  - Bacillus subtilis constitutive (non-inducible) Dat1 enzyme.
  24.  - Yeast DNA repair enzyme MGT1.
  25.  - Mammalian MGMT protein [3].
  26.  
  27. In  all  these  enzymes  the region around the active site cysteine residue is
  28. conserved and can be used as a signature pattern.
  29.  
  30. -Consensus pattern: [LIVMF]-P-C-H-R-[LIVMF](2)
  31.                     [C is the active site residue]
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34. -Last update: December 1992 / Text revised.
  35.  
  36. [ 1] Lindahl T., Sedgwick B., Sekiguchi M., Nakabeppu Y.
  37.      Annu. Rev. Biochem. 57:133-157(1988).
  38. [ 2] Samson L.
  39.      Mol. Microbiol. 6:825-831(1992).
  40. [ 3] Rafferty J.A., Elder R.H., Watson A.J., Cawkwell L., Potter P.M.,
  41.      Margison G.P.
  42.      Nucleic Acids Res. 20:1891-1895(1992).
  43.